Séminaire – Université Laval, 13 novembre

le 11 novembre 2008 à 11:20
Jean-Francois Plante

Huitième séminaire de statistique – A08

Le jeudi 13 novembre 2008, à 13 h 30,
à la salle 1240 du pavillon Alexandre-Vachon

Modèles de classes latentes pour des données de pédigrées:
application à l’analyse de liaison génétique

par

Aurélie Labbe
Département de mathématiques et statistique, Université Laval

Résumé:
Considérant des données cliniques provenant d’un ensemble de pedigrées, nous avons développé une méthode permettant d’identifier des sous-types homogènes de maladies, basés sur un ensemble de mesures cliniques. Nous avons auparavant étendu les modèles de classes latentes en considérant la dépendance entre les classes latentes de maladie et les individus d’une même famille nucléaire. Ici, nous présentons un algorithme qui permet d’effectuer les calculs nécessaires à notre modèle, dans le cadre de familles étendues. Cet algorithme découpe chaque famille en familles nucléaires, similairement à l’algorithme de Elston-Stewart en analyse de liaison génétique. Nous présentons des simulations illustrant le comportement de notre approche en fonction de différentes structures de pedigrees. Nous présentons aussi une illustration de notre approche en analyse de liaison génétique.

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